民勤縣配套完善規范性文件，加強制度建設。全面落實《武威市節水型社會建設規劃》《武威市節約用水管理辦法》和《武威市農業用水水權交易指導意見》等相關文件精神，分年度制定了節水型社會建設實施方案、出臺了實施水資源費征收管理辦法細則、水資源配置方案、以水定電以電控水管理辦法、地下水計量控制設備管理辦法、水票使用管理辦法、水權交易辦法、田間水利工程運行管理辦法、農業用水實行差別水價實施細則、村級農民用水者協會經費管理辦法、民勤縣行業用水定額等相關規章制度，并不斷完善農業、城市和工業節水管理的一系列規章制度及節水責任考核辦法，制度建設趨于完善。
民勤縣強化總量控制。建立完善用水總量控制指標體系，制定縣、鄉鎮、行業年度水資源分配方案，按農田灌溉斗口井口綜合灌溉畝均410方、生態用水畝均160方、城鎮及農村居民生活用水每人每天75升和40升、工業企業萬元產值73方的標準，明確縣、鄉鎮、用水戶及行業用水總量控制指標，逐級落實到各級監管單位、各鄉鎮、各行業和每個用水戶。同時，制定落實《民勤縣水資源預算執行審計監督辦法》，積極探索水資源年初預算、年內審計、年終決算的預算審計管理新模式，采取查閱鄉鎮和水務部門水權配置檔案、審查基層水管單位水電管理資料、上井查看和走訪農戶進行抽樣等方式，對水權配置、審批、使用進行分階段跟蹤審計。
民勤縣通過調整基本水價、實行差別水價、開展水權交易、實施“三水”聯合調度、強力行政推動以及加快水資源信息化管理進程等措施，不斷深化水權水價制度改革，以水資源的優化配置，實現水資源效益的最大化。實行差別水價政策和超定額累進加價制度，對設施農牧業、特色林果業和實施滴灌的大田節水作物及生態用水，免征地下水資源費，地表水水價優惠30%，地下水水價優惠50%；對于傳統方式種植的高耗水低效益作物上浮水價，超定額用水實行累進加價制度。建立多個水權交易試點，鼓勵高耗水種植業水權向低耗水高效益的特色林果業、設施農業以及非農行業流轉，2010年以來，累計交易水權130萬立方米，實現了水資源的二次優化配置。
民勤縣對水資源實行統一調度，實現水權落實的實時監控和信息化管理，是水資源管理工作的方向和重點，也是鞏固石羊河流域重點治理成果的主要措施。目前，民勤縣已在三干、七干和昌寧灌區率先開展了水資源信息化管理試點工作，與科研單位建立合作關系，結合水資源管理實際，聯合研制開發了灌區地下水信息化管理系統軟件，配備齊全硬件基礎設施，建立完善了遠程遙控關機、水電量數據傳輸、適時監控等信息化管理功能。各灌區通過網絡相互鏈接，統一調度水資源。