在全球氣候變暖、工業化進展加快的大背景下，桂林水生態系統面臨諸多問題的挑戰，漓江水生資源不斷衰減，生態退化、湖泊萎縮、濕地干涸、水質惡化，洪澇災害等諸多問題日趨嚴重。

2005年8月，水利部確定桂林市為全國第一個水生態系統保護和修復試點，工程建設計劃投資100.11億元。

5年來，試點工作得到水利部、自治區、自治區水利廳及桂林市等各級各相關部門的高度重視。在試點投資渠道上，桂林市采取“政府主導、各部門多方籌措”的方式，爭取財政資金支持和銀行貸款，鼓勵社會資金參與試點項目建設，拓寬投融資渠道，共投入試點有關項目經費81.27億元，主要用于生態水庫、防污治污、環城水系生態修復等項目建設。

試點實施期間，桂林市將試點工作與城市整體發展目標全方位結合。結合創城活動的開展，重點實施了漓江生態補水工程建設、漓江支流整治工程、污水治理工程及垃圾填埋場等一批試點關鍵項目工程。同時，試點工作實施注重和桂林的歷史文化、山水文化、現代科技等有機結合，實施了一系列具有濃厚桂林特色的關鍵性工程。

據統計，近年與整個試點工作有關的項目計劃共需投入經費100.11億元，已經實施完成投資61.71億元，正在實施的項目資金共38.4億元。通過試點項目實施，桂林市建立完善水資源監測體系和漓江水質監測網絡，建設了桂林市水務實時監控與管理系統一期、二期工程；開工建設小溶江、川江、斧子口三座生態水庫；開展全境防污治污，城區污水集中處理率達90.4%，漓江主要河段水質達到Ⅱ類標準；開展了市區湖泊生態修復，實施了“兩江四湖”水生態修復與水環境治理工程、訾洲島生態整治工程，實施漓江生態護岸工程、市區內河湖綜合整治工程；開展了漓江生物多樣性保護，貓兒山自然保護區、城市水務實時監控系統建設、漓江魚類產卵場及魚類生境保護等工作，還積極探索建立了水生態系統保護與修復長效機制。