貴州省政府批準實施了《赤水河流域水污染防治生態補償辦法》(以下簡稱《辦法》)，《辦法》規定，按照“保護者受益，利用者補償，污染者賠償”的原則，在畢節市和遵義市之間建立上下游區域間橫向的水污染防治生態補償機制。赤水河流域生態補償實施雙向補償，即上游畢節市出境斷面水質優于Ⅱ類水質標準，下游受益的遵義市應繳納生態補償資金;上游畢節市出境斷面水質劣于Ⅱ類水質標準，畢節市應繳納生態補償資金。生態補償資金統一繳入省級財政，由省財政廳會同省環保廳按照定向使用原則，通過因素法進行分配。

貴州省環保廳高度重視建立赤水河流域水污染防治生態補償機制，立即安排部署相關工作。一是全面啟動了赤水河流域生態補償機制涉及的跨市、跨縣(區、市)河流12個水質自動監測站建設，并定期調度督查自動站建設進展，目前12個水質自動監測站全面建成并投運;二是配合水利廳研究審查了赤水河流域生態補償機制涉及的水文站建設方案，目前方案已定稿;三是會同水利廳，明確了赤水河生態補償有關考核斷面的水質、水量監測工作。