淮河流域是我國水資源短缺和水污染嚴重地區，水資源保護工作經歷了水質保護、水功能區保護和河湖生態保護的發展歷程。黨中央、國務院高度重視淮河水污染防治和水資源保護工作，將淮河列入國家“三河三湖”流域水污染治理的重點。

    據水利部淮委總工程師顧洪介紹，2000年以來，工業污染源治理和城鎮污水處理設施建設步伐不斷加快，至2009年全流域已建成城鎮污水處理廠253座，形成處理能力約965萬噸每日，城鎮污水集中處理率達到七成以上，全流域入河排污總量顯著減少。據監測，2009年淮河流域主要污染物COD入河排放量為55.08萬噸，比治污初期1995年的150萬噸削減了63.3%；省界斷面水質明顯改善，2009年淮河流域省界斷面水質為Ⅴ類和劣Ⅴ類的測次占44.2%，比1995年的75.3%下降了31.1%；流域內重大水污染事故明顯減少，2005年以來淮河干流未發生重大水污染事故。

    據悉，淮河流域管理機構、省、市三級監測體系基本形成，建成29個水環境監測中心和分中心，實施監測項目100多項，全流域889個水功能區和1400多個重點入河排污口全部納入監測范圍。水質監測領域不斷拓展，開展地下水、飲用水源地有毒有機物監測和河湖生態監測，為水資源保護提供了重要的技術支撐。