為進一步治理水污染，深圳年內將建設200公里污水管網。最新一期政府公報下發2012年深圳市治污保潔工程實施方案，由于今年深圳將迎來第三次國家環保模范城市復核，將有一系列涉及到水環境治理項目上馬和竣工。
水污染治理方面，深圳將全力推進龍崗河、坪山河、觀瀾河、深圳河、茅洲河流域水污染治理工作，龍崗河流域將率先實現流域旱季污水100%收集處理。
具體項目方面，將建成龍華污水處理廠二期(25萬噸/日)、觀瀾污水處理廠二期(20萬噸/日)和平湖污水處理廠二期(5 .5萬噸/日)。完成水頭污水處理廠(4萬噸/日)、葵涌污水處理廠(4萬噸/日)、龍田污水處理廠(5萬噸/日)和沙田污水處理廠(3萬噸/日)的環保竣工驗收。完成200公里的污水管網建設任務，積極推進中水回用工程。
除了水環境治理，大氣污染治理也是重點。根據方案，深圳將加速推進電廠降氮脫硝，完成媽灣電廠、中海油、南天電力共5臺機組低氮燃燒改造。將依法關停無證鍋爐，逐步淘汰10蒸噸/小時以上的高污染鍋爐。此外，今年將完成老虎坑垃圾焚燒廠二期工程建設，加快老虎坑垃圾填埋場二期工程的建設進程，積極推進南山垃圾焚燒廠二期工程和東部垃圾焚燒處理項目的環評審批工作。