根據水利部要求，4月中下旬，淮委組成兩個檢查組對豫皖蘇魯四省中小河流治理和重點縣綜合整治工作進行了指導檢查。淮河流域中小河流治理工作總體進展順利。
流域各省分別從責任制落實、工作機制建立、資金籌措與管理以及監督檢查和績效評價等方面入手，采取多種行之有效的舉措推動工作有力開展。責任制落實方面，四省領導重視，組織有力。各省政府與有關市政府、地市與有關縣（市）級政府均簽訂了責任書，層層落實責任。四省結合本省特點形成了各具特色的工作機制，并加強組織領導和協調工作。此外，各省均按要求督促市縣及時填報中小河流項目管理系統信息并進行認真審核。前期工作方面，有關省制定了前期工作管理辦法或印發了相關文件。各省均分年度制定項目前期工作安排計劃，層層落實責任，嚴格審批程序，加強技術培訓和指導，保證了前期工作質量。資金籌措與管理方面，四省財政和水利部門建章立制、統籌安排，加大中小河流治理項目資金支持和管理力度，保障中小河流治理項目順利實施。并結合實際情況對東、中、西部不同區域的省市縣投資比例做出不同規定。并制定出臺相關辦法督促落實配套資金，規范資金使用。建設管理方面。各省均采取措施督促市縣嚴格落實“四制”管理，按照屬地原則以縣（市）為單位組建項目法人，以省（市）水利工程招標投標服務中心為平臺，統一監管、運作規范。在工程建設過程中，項目法人、監理及施工單位，認真落實質量安全責任制，加強工程質量檢測，建立健全質量安全監督體系，保證工程質量。監督檢查方面。流域四省均較重視中小河流治理在建工程的監督檢查工作，并抓緊抓實督促整改工作。同時，四省均開展了績效評價工作，安徽、江蘇兩省還制定了本省中小河流治理財政專項資金績效評價實施細則。
截至四月下旬，流域四省列入近期治理規劃的項目初步設計已全部批復，工程已全部完工，完成綜合治理河長6695km，占規劃治理河長的97%；已竣工驗收項目349項，完成驗收比例為73%。流域四省列入實施方案（2013～2015年）項目已批復初步設計818項，批復總投資206.61億元，項目審批率86％；已開工項目549項，占已下達計劃項目數的92％。重點縣綜合整治試點規劃截至檢查時，已批復131個項目區實施方案，項目區批復率26％，批復總投資36.66億元。101個項目區已開工，項目區開工率為20%。