新疆維吾爾自治區位于我國西部，地處亞歐大陸腹地，是我國境內距離海洋最遠的省區，基本地貌輪廓通稱為“三山夾兩盆”。所謂“三山”指新疆境內從北到南排列分布的阿爾泰山、天山和昆侖山諸山系；“兩盆”是指分別夾在三座山脈之間的準噶爾盆地和塔里木盆地。在三山夾兩盆的西端，矗立著高聳入云的帕米爾高原，它如同一條彩帶，蜿蜒曲折地由北至南呈斜狀將阿爾泰山、天山和昆侖山諸山系聯結在一起。

三面高山環繞，大體上使新疆形成一個天然的封閉地理單元，大部分地域則因為高山相隔，來自海洋的東亞季風、西南季風等濕潤氣流很難到達這里，從而使新疆成為我國最為特殊的內陸干旱區。水資源的缺乏和空間分布不均使新疆生態環境脆弱，這也是新疆產業發展的主要制約條件。如何解決水資源“瓶頸”，筆者有如下建議：

一、結構性調整與高效節水相結合，促進水資源高效利用

新疆水資源利用的主要問題是用水量大而效益不高，農業用水長期占新疆總用水量的95%以上，農業糧經草結構失衡，高耗水作物比重較大，經濟結構還屬于用水效率和效益不高的傳統農業社會。因此，著力開展結構性調整，使之由農業社會逐步轉型為新型工業化社會，加快節水型社會建設，減少或抑制對水資源的需求，降低農業用水量和用水比例，是促進新疆水資源可持續高效利用的關鍵所在。

二、優先加大國際河流區水資源開發力度，建設新疆水源調蓄基地

國際河流區水資源在新疆極具戰略地位。通過引額供水、艾比湖生態環境保護、塔里木河生態環境保護等戰略性工程建設，奠定伊、額兩河水資源在新疆水資源合理配置格局中的全局性作用。在當前的水利發展思路下，盤活國際河流水資源就基本可破解新疆水資源瓶頸。

三、強化流域水資源統一管理，提高全疆水資源調控能力

流域管理與行政管理相結合是當前新疆水資源管理的基本模式，但總體而言流域管理處于弱勢地位。加之兵團與地方的交叉融合，新疆水資源統一管理存在的問題較多，需著力推廣流域水資源統一管理，從供水管理為主轉變為以需水管理為基礎，健全水資源管理體制與機構，強化水資源的統一規劃、配置與管理，進一步完善水資源利用、管理的政策法規，建立跨行業(部門)的水資源利用協商機制。實行最嚴格的水資源管理制度，建立3條紅線：水資源開發利用控制紅線，嚴格實行用水總量控制；用水效率控制紅線，實行定額管理，堅決遏制用水浪費；水功能區限制納污紅線，嚴格控制入河排污總量。

實施流域水資源統一管理的重要前提是建立必要的控制性工程，提高對水資源的調控能力。新疆水利建設歷史欠賬較多，全疆水資源的工程調控能力不強，既浪費了寶貴的水資源，給當地人民群眾造成生命和財產損失，不利于破解水資源時空分布與經濟社會發展格局不匹配的困境，區域性水資源合理配置難以形成，又往往導致水資源的流域統一管理落空。

四、適度開采淺層地下水，將深層地下水作為水資源戰略儲備，加強水污染防治

淺層地下水是生態保護的最后一道防線，它的崩潰將會帶來無法彌補的生態災難。

   目前，新疆總體上地下水過度超采、深井開采現象日益嚴重，導致地下水位持續下降、地下水質惡化，不少地區地下水面臨枯竭危險。保護地下水，減少地下水超采已是當務之急，超采區應逐步實行采補平衡，南疆打井應適度，避免過度開發。除此外，為應對氣候變化可能造成水資源量的減少、特殊干旱和水源嚴重污染的突發事件，需將深層地下水作為戰略儲備，保障水資源安全。
目前，新疆地表水體已經受到不同程度的污染，地下水質不容樂觀，水環境污染日漸顯現，城市污水、工業廢水以及受污染水體的治理尚有很大差距，存在較大的健康和生態風險。因此，應切實提高環境意識，加強水污染防治力度，包括：從源頭治理開始，強化節水；加強污水儲存與利用監管；加強農業面源污染控制；加強調水過程中的污染防治；將城市污水處理建設納入城市發展總體規劃。